Confocal Multimode Live-Cell Imaging: an efficient tool for quantification of molecular interactions

Er bestaan diverse, vaak geavanceerde, fluorescentie microscopische technieken om de aanwezigheid van eiwitten, hun plaats in de cel, hun dynamiek en hun interacties met andere eiwitten te bepalen. Bijvoorbeeld technieken waarbij de aard van de fluorescentie verandert als twee eiwitmoleculen zeer dicht bij elkaar in de buurt komen. Vier van deze technieken zijn geïntegreerd in een enkele confocale microscoop en de microscopie werd geautomatiseerd. Daardoor is het mogelijk veel metingen in korte tijd te doen. Bovendien zijn de technieken zo gekozen dat ze elkaar aanvullen. De microscoop is ingezet voor onderzoek aan ondermeer genetische schakelaars, communicatie tussen cellen, immunologische reacties, het transport van eiwitten in cellen en celbeweging.

Producten

Titel: FRET and FLIM techniques
Auteur: Jalink, K., van Rheenen, J. Editor Th Gadella
Link: http://uitgeverij is Elzevier maar die zie ik niet
Titel: Activation of TRPM7 channels by phospholipase C-coupled receptor agonists.
Auteur: Langeslag M, Clark K, Moolenaar WH, van Leeuwen FN, Jalink K.
Magazine: Journal of Biological Chemistry
Titel: A comparison of donor-acceptor pairs for genetically encoded FRET sensors: application to the Epac cAMP sensor as an example.
Auteur: van der Krogt GN, Ogink J, Ponsioen B, Jalink K.
Magazine: PLoS ONE
Titel: LPA is a chemorepellent for B16 melanoma cells: action through the cAMP-elevating LPA5 receptor.
Auteur: Jongsma M, Matas-Rico E, Rzadkowski A, Jalink K, Moolenaar WH.
Magazine: PLoS ONE
Titel: ATP changes the fluorescence lifetime of cyan fluorescent protein via an interaction with His148.
Auteur: Borst JW, Willemse M, Slijkhuis R, van der Krogt G, Laptenok SP, Jalink K, Wieringa B, Fransen JA.
Magazine: PLoS ONE
Titel: Spatiotemporal regulation of chloride intracellular channel protein CLIC4 by RhoA.
Auteur: Ponsioen B, van Zeijl L, Langeslag M, Berryman M, Littler D, Jalink K, Moolenaar WH.
Magazine: Molecular Biology of the Cell
Titel: Phosphorylation of threonine 1736 in the C-terminal tail of integrin beta4 contributes to hemidesmosome disassembly.
Auteur: Frijns E, Kuikman I, Litjens S, Raspe M, Jalink K, Ports M, Wilhelmsen, K, Sonnenberg
Magazine: Molecular Biology of the Cell
Titel: Regulation of connexin43 gap junctional communication by phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate.
Auteur: van Zeijl L, Ponsioen Ba, Giepmans BN, Ariaens A, Postma FR, Varnai P, Balla T, Divecha N, Jalink K, Moolenaar WH.
Magazine: Journal of Cell Biology
Titel: Investigation into the mechanism regulating MRP localization.
Auteur: van den Bout I, van Rheenen J, van Angelen AA, de Rooij J, Wilhelmsen K, Jalink K, Divecha N, Sonnenberg A.
Magazine: Experimental Cell Research
Titel: PKA-induced resistance to tamoxifen is associated with an altered orientation of ERalpha towards co-activator SRC-1
Auteur: Zwart W, Griekspoor A, Berno V, Lakeman K, Jalink K, Mancini M, Neefjes J, Michalides R
Magazine: EMBO Journal
Titel: Intravital imaging of fluorescent markers and FRET probes by DNA tattooing.
Auteur: Bins AD, van Rheenen J, Jalink K, Halstead JR, Divecha N, Spencer DM, Haanen JB, Schumacher TN.
Magazine: BMC Biotechnology
Titel: Direct measurement of cyclic AMP diffusion and signaling through connexin43 gap junctional channels.
Auteur: Ponsioen B, van Zeijl L, Moolenaar WH, Jalink K.
Magazine: Experimental Cell Research
Titel: Spatiotemporal Coupling of cAMP Transporter to CFTR Chloride Channel Function in the Gut Epithelia.
Auteur: Li C, Krishnamurthy PC, Penmatsa H, Marrs KL, Wang XQ, Zaccolo M, Jalink K, Li M, Nelson DJ, Schuetz JD, Naren AP.
Magazine: Cell
Titel: A mTurquoise-based cAMP sensor for both FLIM and ratiometric read-out has improved dynamic range.
Auteur: Klarenbeek JB, Goedhart J, Hink MA, Gadella TW, Jalink K.
Magazine: PLoS ONE
Titel: Parathyroid hormone activates TRPV5 via PKA-dependent phosphorylation.
Auteur: de Groot T, Lee K, Langeslag M, Xi Q, Jalink K, Bindels RJ, Hoenderop JG.
Magazine: Journal of the American Society of Nephrology
Titel: Nano-imaging of membrane topography affects interpretations in cell biology
Auteur: K.Jalink, J. van Rheenen
Magazine: Nature Methods
Titel: Myosin II and mechanotransduction: a balancing act.
Auteur: Clark K, Langeslag M, Figdor CG, van Leeuwen FN.
Magazine: Trends in Cell Biology
Titel: Quantitative image correction and calibration for confocal fluorescence microscopy using thin reference layers and SIPchart-based calibration procedures.
Auteur: J.M.Zwier, L.Oomen, L.Brocks, K.Jalink, G.J.Brakenhoff
Magazine: Journal of Microscopy
Titel: 8-pCPT-2'-O-Me-cAMP-AM: an improved Epac-selective cAMP analogue.
Auteur: Vliem MJ, Ponsioen B, Schwede F, Pannekoek WJ, Riedl J, Kooistra MR, Jalink K, Genieser HG, Bos JL, Rehmann H.
Magazine: Chembiochem
Titel: TRPM7 Is Required for Breast Tumor Cell Metastasis.
Auteur: Middelbeek J, Kuipers AJ, Henneman L, Visser D, Eidhof I, van Horssen R, van Leeuwen, F, Jalink K.
Magazine: Cancer Research
Titel: Direct spatial control of Epac1 by cyclic AMP.
Auteur: Ponsioen B, Gloerich M, Ritsma L, Rehmann H, Bos JL, Jalink K.
Magazine: Molecular and Cellular Biology
Titel: Immersion oil for high-resolution live-cell imaging at 37 degrees C: optical and physical characteristics.
Auteur: L.C. Oomen, R. Sacher, H.H. Brocks, J.M. Zwier, G.J. Brakenhoff, K.Jalink
Magazine: Journal of Microscopy
Titel: Bright cyan fluorescent protein variants identified by fluorescence lifetime screening
Auteur: J.Goedhart, L.van Weeren, M.A.Hink, N.O.Vischer, K.Jalink, T.W.Gadella Jr.
Magazine: Nature Methods
Titel: Spatiotemporal regulation of chloride intracellular channel protein CLIC4 by RhoA
Auteur: Ponsioen, L. van Zeijl, M.Langeslag, M.Berryman, D.Littler, K.Jalink, W.H.Moolenaar
Magazine: Molecular Biology of the Cell
Titel: Spatial regulation of cyclic AMP-Epac1 signaling in cell adhesion by ERM proteins.
Auteur: Gloerich M, Ponsioen B, Vliem MJ, Zhang Z, Zhao J, Kooistra MR, Price LS, Ritsma L, Zwartkruis FJ, Rehmann H, Jalink K, Bos JL.
Magazine: Molecular and Cellular Biology
Titel: Resistance to antiestrogen arzoxifene is mediated by overexpression of cyclin D1.
Auteur: Zwart W, Rondaij M, Jalink K, Sharp ZD, Mancini MA, Neefjes J, Michalides R.
Magazine: Molecular Endocrinology
Titel: # Shedding light on anti-estrogen resistance and antigen presentation through biophysical techniques
Auteur: W.T.Zwart
Titel: Imaging the translocations of Clic4 and Epac1
Auteur: B. Ponsioen

Verslagen


Eindverslag

De recente doorbraken in moleculaire technieken hebben geleid tot de identificatie van vele voor biomedisch onderzoek belangrijke genen. Om de functie van de eiwit-producten van al deze genen te begrijpen, moeten we gedetailleerde informatie verzamelen over hun voorkomen, plaats in de cel, hun dynamiek en hun interacties met andere eiwitten. Daartoe worden een aantal verschillende, veelal geavanceerde, fluorescentie microscopie technieken gebruikt.
In dit project hebben we ee viertal van de meest bruikbare daarvan geintegreerd op een enkele confocale microscoop. De microscoop is in hoge mate geautomatiseerd zodat een veelvoud aan metingen mogelijk is in dezelfde tijd. Bovendien zijn deze technieken zo gekozen dat ze complementaire informatie opleveren.
De implementatie, in samenwerking met de leverancier Leica uitgevoerd, is een groot succes gebleken. Diverse van de ontwikkelingen die we hebben uitgevoerd zijn nu standaard in nieuw te leveren apparatuur van deze leverancier (Leica), en van de negen wetenschappelijke deelprojecten die we hadden gedefinieerd hebben er 8 geleid tot een of meerdere publicaties in peer-reviewed tijdschriften.

Snel naar

Kenmerken

Projectnummer:
91106027
Looptijd: 100%
2006
2010
Gerelateerde programma's:
Gerelateerde subsidieronde:
Projectleider en penvoerder:
Dr. K. Jalink
Verantwoordelijke organisatie:
Nederlands Kanker Instituut