High throughput analysis of single cells by combined flow cytometry and cell imaging

Het unieke van de Amnis cytometer boven conventionele flow-analyse is dat van individuele cellen, zoals witte bloedcellen, niet alleen kan worden nagegaan welke eiwitten elke cel bevat maar ook waar deze in de cel zitten, en of de lokalisatie verandert bij bepaalde ziekten of wanneer de cel geactiveerd raakt. Dit is mogelijk doordat van elke cel een foto gemaakt en geanalyseerd wordt. Omdat dit bij een groot aantal cellen tegelijk kan worden uitgevoerd biedt dit ongekende mogelijkheden om differentiatieprocesssen in lymfocyten en andere cellen te bestuderen.

Producten

Titel: BODIPY-labeled DC-SIGN-targeting glycodendrons efficiently internalize and route to lysosomes in human dendritic cells
Auteur: Ribeiro-Viana R, García-Vallejo JJ, Collado D, Pérez-Inestrosa E, Bloem K, van Kooyk Y, Rojo J.
Magazine: Biomacromolecules
Titel: Glycodendrimers prevent HIV transmission via DC-SIGN on dendritic cells
Auteur: Garcia-Vallejo JJ, Koning N, Ambrosini M, Kalay H, Vuist I, Sarrami-Forooshani R, Geijtenbeek TB, van Kooyk Y
Magazine: International Immunology
Titel: Interaction of the Capsular Polysaccharide A from Bacteroides fragilis with DC-SIGN on Human Dendritic Cells is Necessary for Its Processing and Presentation to T Cells
Auteur: Bloem K, García-Vallejo JJ, Vuist IM, Cobb BA, van Vliet SJ, van Kooyk Y
Magazine: Frontiers in Immunology
Titel: Multivalent glycopeptide dendrimers for the targeted delivery of antigens to dendritic cells
Auteur: García-Vallejo JJ, Ambrosini M, Overbeek A, van Riel WE, Bloem K, Unger WW, Chiodo F, Bolscher JG, Nazmi K, Kalay H, van Kooyk Y
Magazine: Molecular Immunology

Verslagen


Eindverslag

Flowcytometrie is een niet meer weg te denken toepassing bij het karakteriseren van grote hoeveelheden cellen. Door de mogelijkheid verschillende parameters tegelijkertijd te meten kunnen zeer kleine aantallen cellen geselecteerd worden uit grote populaties, zoals stamcellen in het bloed. Een nadeel van de analysemogelijkheden van de flowcytometer is dat het mogelijk is om te analyseren of een bepaald eiwit op of in de cel zit, maar dat het onmogelijk is om aan te tonen waar precies in de cel een eiwit zit en of het eiwit in een bepaald organel zit, zoals een kern of een lysosoom, en of het eiwit op dezelfde plek zit als een ander eiwit, of juist niet. Deze vragen zijn op te lossen met microscopie, maar dan slechts met kleine aantallen cellen, of met biochemische technieken zoals coprecipitatie, waarbij geen informatie over individuele cellen beschikbaar is. Hierdoor blijft het moeilijk om celsignalering, kerntranslocatie, cocapping e.d. reproduceerbaar te bestuderen op grote hoeveelheden cellen. Dit kan wel met de Amnis Imagestream waarin de kwantitatieve analysemogelijkheid van een flowcytometer gecombineerd is met de resolutie van een microscoop. Van elke cel wordt bij analyse een foto gemaakt, in helder veld en met fluorescentiesignaal, en deze data worden gebruikt om precies na te gaan waar in de cel bepaalde moleculen zich bevinden, met welke moleculen dit samenvalt, hoe dit verandert bij het activeren van de cel enzovoort. Dit is van grote waarde bij het onderzoek binnen de immunologie en oncologie, maar ook toepassingen binnen bloedcelontwikkeling hebben baat bij deze machine. Diverse onderzoeksgroepen binnen het VUmc hebben de Imagestream omarmd en gebruiken de machine intensief voor hun onderzoek.

Snel naar

Kenmerken

Projectnummer:
91110005
Looptijd: 100%
2010
2014
Gerelateerde programma's:
Gerelateerde subsidieronde:
Projectleider en penvoerder:
Prof. dr. G. Kraal
Verantwoordelijke organisatie:
Amsterdam UMC - locatie VUmc