LTQ-Orbitrap,high-resolution mass-spectrometer for proteomic (and metabolomic) analyses

Producten

Titel: Human primary adipocytes exhibit immune cell function: adipocytes prime inflammation independent of macrophages.
Auteur: Meijer K, de Vries M, Al-Lahham S, Bruinenberg M, Weening D, Dijkstra M, Kloosterhuis N, van der Leij RJ, van der Want H, Kroesen BJ, Vonk R, Rezaee F.
Magazine: PLoS ONE
Titel: Analysis of two additional signaling molecules in Streptomyces coelicolor and the development of a butyrolactone-specific reporter system.
Auteur: Hsiao NH, Nakayama S, Merlo ME, de Vries M, Bunet R, Kitani S, Nihira T, Takano E.
Magazine: Chemistry & Biology
Titel: Separating the wheat from the chaff: a prioritisation pipeline for the analysis of metabolomics datasets
Auteur: Andris Jankevics, Maria Elena Merlo, Marcel de Vries, Roel J. Vonk, Eriko Takano and Rainer Breitling
Magazine: Metabolomics
Titel: Human plasma very low density lipoprotein carries Indian hedgehog
Auteur: Queiroz, K.C.S., Tio, R.A., Zeebregts, C.J., Bijlsma, M.F., Zijlstra, F., Badlou, B., De Vries, M., Ferreira, C.V., Spek, C.A., Peppelenbosch, M.P., Rezaee, F.
Magazine: Journal of Proteome Research
Titel: Electrochemical oxidation of quaternary ammonium electrolytes: Unexpected side reactions in organic electrochemistry.
Auteur: Nouri-Nigjeh, Eslam, de Vries, Marcel P., Bruins, Andries P., Bischoff, Rainer, & Permentier, Hjalmar P.
Magazine: Electrochemistry Communications
Titel: Separating the wheat from the chaff: A prioritisation pipeline for the analysis of metabolomics datasets.
Auteur: Jankevics, A., Merlo, M. E., de Vries, M., Vonk, R. J., Takano, E., & Breitling, R.
Magazine: Metabolomics
Titel: No de novo sulforaphane biosynthesis in broccoli seedlings.
Auteur: Antonie Gorissen, Nicolai U. Kraut, Ries de Visser, Marcel de Vries, Han Roelofsen, Roel J. Vonk.
Magazine: Food Chemistry
Titel: Comparative analysis of the human hepatic and adipose tissue transcriptomes during LPS-induced inflammation leads to the identification of differential biological pathways and candidate biomarkers.
Auteur: Szalowska E, Dijkstra M, Elferink MG, Weening D, de Vries M, Bruinenberg M, Hoek A, Roelofsen H, Groothuis GM, Vonk RJ
Magazine: BMC Medical Genomics
Titel: Comparison of isotope-labeled amino acid incorporation rates (CILAIR) provides a quantitative method to study tissue secretomes.
Auteur: Roelofsen H, Dijkstra M, Weening D, de Vries MP, Hoek A, Vonk RJ.
Magazine: Molecular and Cellular Proteomics
Titel: Metabolomic characterization of the salt stress response in Streptomyces coelicolor
Auteur: Kol S, Merlo ME, Scheltema RA, de Vries M, Vonk RJ, Kikkert NA, Dijkhuizen L, Breitling R, Takano E.
Magazine: Applied and Environmental Microbiology
Titel: Propionate: a candidate metabolite to link colonic metabolism to human adipose tissue inflammation
Auteur: Sa'ad H.M. Al-Lahham
Titel: Surfing the metabolome
Auteur: R.A. Scheltema
Titel: An adipocentric view of the development of insulin resistance
Auteur: E. Szalowska

Verslagen


Eindverslag

De Groningen Proteomics Faciliteit (www.medicalproteomics.com) bezit een verscheidenheid aan massaspectrometers voor proteomics analyse. Deze infrastructuur is onderdeel van een gemeenschappelijke activiteit van de Universiteit van Groningen(RUG) en het Universitair Medisch Centrum Groningen (UMCG). De,door ZON-MW gefinancieerde, ThermoFinnigan LTQ-Orbitrap complimenteert deze infrastructuur omdat het (ultra)hoge-resolutie proteomics en metabolomics analyses mogelijk maakt. In de afgelopen twee jaar hebben we geïnvesteerd in het ontwikkelen van proteomics and metabolomics methoden. Het instrument is gebruikt door verschillende onderzoekers voor pilot experimenten. Verder speelt het instrument een belangrijke rol in verschillende ingediende subsidieaanvragen. Tot dusver zijn methoden ontwikkeld voor de studie naar eiwitexpressie in vetweefsel en adipocyten, eiwitcompositie van melk, zout-stress geinduceerde metabole veranderingen in bacteria en bioactieve componenten in voedsel en hun metabolisme in het lichaam. Dit heeft tot dusver geleid to vijf publicaties, drie proefschriften en vijf ingediende manuscripten en vijf abstracts die gepresenteerd zijn op internationale bijeenkomsten.

Snel naar

Kenmerken

Projectnummer:
91107007
Looptijd: 100%
2007
2011
Gerelateerde programma's:
  • Investeringen Groot en Middelgroot
Gerelateerde subsidieronde:
Investeringen Middelgroot 2006
Projectleider en penvoerder:
Prof. dr. R.J. Vonk
Verantwoordelijke organisatie:
Universiteit Maastricht