Implementatie naar ‘general use’ van het COMPASS personalized medicine model in R2
Deze verspreidings- en implementatie-impuls (VIMP) is een vervolg op het project Clinical implementation Of Multidimensional PhenotypicAl drug SenSitivities in paediatricprecision oncology (COMPASS).
Binnen het COMPASS project heeft een internationaal team van wetenschappers de basis gelegd om
het testen van vele medicijnen op gebiopteerde tumorcellen te standaardiseren. Binnen dit project is
ook gewerkt aan software implementatie binnen het AmsterdamUMC R2 analyse en visualisatie
platform (https://r2.amc.nl). Op deze manier worden de resultaten van deze medicijnprofilering inzichtelijk gemaakt voor wetenschappelijk gebruik.
In het huidige VIMP project bouwt het R2-team in het AUMC de datapresentatie binnen het R2 platform
verder uit richting bruikbaarheid voor zorgprofessionals. In samenspraak met clinici en wetenschappers in het Prinses Maxima Centrum, zullen de presentatie- en analysemogelijkheden voor gebruik binnen het ‘personalized medicine’ programma, waar momenteel al medicijnprofilering plaatsvindt, worden geoptimaliseerd. Met de uitbreiding van R2 zal men beter in staat zijn om de resultaten voor klinische implementatie geschikt te maken.
Doel
Met de ontwikkeling van het R2 platform worden onderzoekers met een beperkte bioinformaticakennis in staat gesteld om zelf complexe genoomanalyses uit te voeren, waardoor hypothesen snel te testen zijn en kunnen leiden tot nieuwe ideeën en inzichten. Voor het domein van ‘personalized medicine’ is er reeds een set aan tools waarmee een expertteam de genoomanalyse van een patiënt kan analyseren op ‘targetable events’. Met een verdere ontwikkeling van de huidige applicatie voor medicijngevoeligheidsdata en de verdere integratie met de genoomanalyses, kan deze rijke bron van informatie voor een groter publiek analyseerbaar gemaakt worden en daarmee bijvoorbeeld ook de behandelende artsen beter bereiken.
Aanpak
De huidige software dient te worden aangepast zodat het gebruik beter aansluit. Daarnaast is het belangrijk om gebruikersgerichte documentatie te genereren die aangeeft hoe het toegepast moet worden en wat de betekenis is van de aangeboden opties. Ook zorgprofessionals worden betrokken bij interpretatie van profleringsdata en er zullen verbeteringen aangebracht worden om de integratie van de medicijndata met andere profileringstechnieken (genexpressie / mutaties) intuïtiever aan te bieden.
Om het bewustzijn rond de huidige technologische mogelijkheden te vergroten, wordt een workshop georganiseerd waarin zowel de kansen van medicijnprofilering in personalized medicine naar voren komen, alsook de verbeterde software implementatie om hiernaar te kunnen kijken met een diverse groep aan gebruikers.