Single-cell karakterisering van membraaneiwitten om kanker immunotherapie in kaart te brengen

Voor de behandeling van kanker is het belangrijk om de complexe wisselwerking tussen de tumor en haar omgeving te begrijpen. Single-cell RNA-sequencing speelde een cruciale rol bij het ontwarren van de complexe signaalsystemen van de tumoromgeving. Niet alle veranderingen in de RNA-topografie vertalen zich echter in eiwitten. Het begrijpen van de veranderingen van vooral de eiwitten op het buitenmembraan van de cel en hoe het ubiquitine-proteasoom
systeem dit eiwitlandschap hervormt, is belangrijk voor een beter begrip van de onderliggende processen. 

Met de nieuwste doorbraken op het gebied van massaspectrometrie kan het proteoom van afzonderlijke cellen worden gemeten, waardoor deze belangrijke leemte wordt opgevuld. In dit project zullen we ons concentreren op de functie van de eiwitten van het buitenmembraan en hun sleutelrol in immuniteit met single-cell resolutie.