Achtergrond afbeelding Achtergrond afbeelding darkmode

Defining the window of treatment for PAX6-associated blindness using novel iPSC-derived corneal organoids

Aniridie gerelateerde keratopathie (ARK) is een aandoening die leidt tot hoornvliesblindheid bij patienten met Aniridie. Er bestaan geen effectieve behandelingen tegen. Het is bekend dat in ARK de buitenste laag van het hoornvlies, het epitheel, wordt aangetast. In dit vooruitstrevende voorstel suggereer ik echter dat ARK-problemen zich al een laag dieper voordoen, in het stroma, en dat het epitheel pas later wordt aangetast.

Om dit te bewijzen, zal ik menselijke hoornvlies-mini-organen maken uit gezonde cellen en cellen van aniridie patiënten. Deze structuren kunnen de ontwikkeling, en ziekten van het hoornvlies nabootsen "in een schaaltje". Samen met geavanceerde eencellige analysetechnieken, zal ik identificeren waar, wanneer en welke veranderingen plaatsvinden in ARK.

Als mijn hypothese juist is, kunnen we een nieuwe behandelmomenten voor ARK vinden en aangrijppunten ontdekken voor nieuwe en vroegtijdige behandelingen om aniridiepatiënten te helpen hun zicht te behouden.

Producten

Titel: Dissecting chromatin accessibility changes during in vitro differentiation of Pluripotent Stem Cell-derived Limbal Epithelial Stem Cells
Auteur: Dulce Lima Cunha, Meri Vatulainen, Pedro Alonso Gonzalez, Julian Arts, Jos Smits, Outi Merlin, Tania Ilmarinen, Heli Skottman, Huiqing Zhou
Link: https://static1.squarespace.com/static/611faaa8fee682525ee16489/t/68e538c4bfc7201c0c94d48c/1759852740390/ISSCR_AM24_PosterAbstractGuidev3_July_22_2024.pdf
Titel: Identification of cell types and states in cornea organoids using single-cell RNA sequencing data analysis
Auteur: Bachelor student: Elsa Berg (2nd internship report) Supervisor: Julian A Arts
Titel: Generation of gene-corrected isogenic induced pluripotent stem cell lines from two aniridia patients with heterozygous PAX6 mutations using CRISPR-Cas9
Auteur: Bachelor student: Elsa Berg Supervisor: Dulce Lima Cunha
Titel: Prediction of cell states and key transcription factors of the human cornea through integrated single-cell omics analyses
Auteur: Julian A Arts , Sofia Fallo , Melanie S Florencio , Jos G A Smits , Dulce Lima Cunha , Janou A Y Roubroeks , Mor M Dickman , Vanessa L S LaPointe , Rosemary Yu , Huiqing Zhou
Magazine: PNAS Nexus
Link: https://academic.oup.com/pnasnexus/article/4/8/pgaf235/8215861
Titel: Deciphering the differentiation of human induced pluripotent stem cell-derived corneal stem cells by gene regulatory networks analysis
Auteur: Dulce Lima Cunha, Meri Vatulainen, Julian Arts, Outi Melin, Tanja Ilmarinen, Heli Skottman, Jo Zhou
Magazine: Acta Ophthalmologica
Link: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1111/aos.16851
Titel: Deciphering the heterogeneity of differentiating hPSC-derived corneal limbal stem cells through single-cell RNA sequencing
Auteur: Meri Vattulainen, Jos G A Smits, Julian A Arts, Dulce Lima Cunha, Tanja Ilmarinen, Heli Skottman, Huiqing Zhou
Magazine: Stem Cell Reports
Link: https://www.cell.com/stem-cell-reports/fulltext/S2213-6711(24)00153-X?_returnURL=https%3A%2F%2Flinkinghub.elsevier.com%2Fretrieve%2Fpii%2FS221367112400153X%3Fshowall%3Dtrue

Kenmerken

  • Projectnummer:
    04510012210043
  • Looptijd: 100%
    Looptijd: 100 %
    2023
    2025
  • Gerelateerde programma's:
  • Gerelateerde subsidieronde:
  • Projectleider en penvoerder:
    dr. D.M. Lima Cunha
  • Verantwoordelijke organisatie:
    Radboud Universiteit Nijmegen