Achtergrond afbeelding Achtergrond afbeelding darkmode

Discerning Environmental Pathways of Campylobacter Transmission (DEPiCT): An interdisciplinary framework for understanding the origins and spread of non-foodborne campylobacteriosis

Campylobacter is de belangrijkste zoonotische verwekker van darminfecties bij mensen. De bacterie verspreid zich van dieren naar mensen via verschillende routes. Tot 80% van humane campylobacteriose gevallen zijn herleidbaar naar kip als bron, maar slechts 40% van deze gevallen kan worden toegeschreven aan het eten van kippenvlees. De verwachting is daarom dat veel Campylobacter infecties het resultaat zijn van transmissie via het milieu. Campylobacter is wijdverbreid in wilde vogels en oppervlaktewater, maar de transmissieroutes van Campylobacter vanuit het milieu naar de mens zijn grotendeels onbekend. Met behulp van microbiologische, genomische en epidemiologische methoden, zal dit project de oorsprong en verspreiding van Campylobacter in het milieu onderzoeken. Daarnaast zal het project de bijdrage van het milieu aan campylobacteriose kwantificeren en zullen transmissieroutes worden geïdentificeerd. Uiteindelijk zal dit project aanknopingspunten bieden voor interventiestrategieën.

Producten

Titel: Tracing the animal sources of surface water contamination with Campylobacter jejuni and Campylobacter coli
Auteur: Mulder AC, Franz E, de Rijk S, Versluis MAJ, Coipan C, Buij R, Müskens G, Koene M, Pijnacker R, Duim B, Bloois LVG, Veldman K, Wagenaar JA, Zomer AL, Schets FM, Blaak H, Mughini-Gras L
Magazine: Water Research
Link: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0043135420309568?via%3Dihub
Titel: Sources and transmission routes of campylobacteriosis: A combined analysis of genome and exposure data
Auteur: Mughini-Gras L, Pijnacker R, Coipan C, Mulder AC, Veludo AF, de Rijk S, van Hoek AHAM, Buij R, Muskens G, Koene M, Veldman K, Duim B, Graaf-van Bloois LV, van der Weijden C, Kuiling S, Verbruggen A, van der Giessen J, Opsteegh M, van der Voort M, Castelijn GAA, Schets FM, Blaak H, Wagenaar JA, Zomer AL, Franz E
Magazine: Journal of Infection
Link: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0163445320307337?via%3Dihub

Verslagen


Eindverslag

Campylobacter is de meest voorkomende veroorzaker van bacteriële gastro-enteritis en verspreidt zich van dieren via verschillende routes, inclusief het milieu, naar mensen. Met een integratieve benadering die genetische en epidemiologische gegevens koppelt bepaalde de onderzoekers dat pluimvee en runderen zijn de belangrijkste bronnen van Campylobacter-infecties bij de mens. Naast landbouwhuisdieren speelt ook transmissie vanuit huisdieren en via oppervlaktewater een rol. Wilde vogels en pluimvee, gevolgd door herkauwers, zijn de belangrijkste bronnen voor besmetting van oppervlaktewater met Campylobacter. Transmissie via het milieu lijkt vooral een rol te spelen bij Campylobacter vanuit runderen. Specifieke genetische kenmerken van Campylobacter zijn geassocieerd met specifieke bronnen maar er is geen verband tussen de genetische samenstelling en de ernst van de symptomen bij de mens. Alhoewel voedsel de belangrijkste bron voor Campylobacter-infecties speelt transmissie via het milieu een relevante rol waar rekening mee gehouden dient te worden.
Dit project heeft tot doel om de belangrijkste bronnen en verspreidingsroutes van Campylobacter in het milieu te identificeren en vervolgens de bijdrage hiervan aan de morbiditeit van humane campylobacteriose via verschillende transmissieroutes te bepalen. Dit onderzoek wordt op een integratieve manier aangepakt, waarbij genetische data (whole-genome-sequencing) van Campylobacter stammen zullen worden gekoppeld met state-of-the-art statistische en epidemiologische methoden. Het tweede jaar van het project markeerde de bijna-voltooiing van de database die in de komende analyses gebruikt zal worden. Monsters zijn verzameld van nagenoeg alle beoogde diersoorten en de omgeving (Tabel 1). Voor een klein deel van de monsters (5,4%) werd de data verzameling verstoord door de zeer hoge temperaturen en droogte die in het afgelopen jaar (2018) in heel Nederland werd waargenomen. Deze en nog eens 10% van de monsters zullen naar verwachting in de komende drie maanden worden verzameld zonder nadelige gevolgen voor de verdere voortgang van het project. Dankzij een samenwerking met de Nederlandse Voedsel- en Warenautoriteit (NVWA) en Wageningen Bioveterinary Research (WBVR) zijn anvullende Campylobacter-isolaten van verschillende diersoorten bemonsterd, zodat het totale aantal beschikbare sequenties momenteel 1337 bedraagt, in plaats van 1200 gepland in het project (Tabel 1). De genetische data en bijbehorende metadata zullen in de komende 24 maanden gebruikt worden voor bronattributie analyses binnen WP5 om de onderzoeksvragen van het project te kunnen beantwoorden.

Snel naar

  • Infectieziekten

    • Kenmerken

    • Projectnummer:
      522003003
    • Looptijd: 100%
      2017
      2022
    • Gerelateerde programma's:
    • Gerelateerde subsidieronde:
      Non-alimentaire zoönosen 2016
    • Projectleider en penvoerder:
      Dr. E. Franz
    • Verantwoordelijke organisatie:
      RIVM