JPIAMR Network for Integrating Microbial Sequencing and Platforms for Antimicrobial Resistance (Seq4AMR)

Genomen van micro-organismen coderen vaak voor resistentie tegen antibiotica - zogenaamde antimicrobiële resistentie (AMR). Dezelfde genomen bevatten al het genetische materiaal van micro-organismen en kunnen in kaart gebracht worden via een techniek die Next Generation Sequencing (NGS) heet. NGS kan gebruikt worden om het ontstaan en verspreiding van AMR te detecteren en te bestrijden. 

Doel

Echter, het potentiële gebruik van NGS bij het bestrijden van AMR wordt voortdurend verfijnd, geholpen door de ontwikkeling van nieuwe sequentietechnologieën, protocollen, algoritmen en AMR-databanken. In dit opzicht zal het Seq4AMR-netwerk AMR NGS-hiaten en oplossingen identificeren, nieuw lesmateriaal ontwikkelen, en een internationale Strategic Roadmap over NGS en AMR publiceren. 

Aanpak/werkwijze

Om dit doel te bereiken, omvatten Seq4AMR-partners interdisciplinaire, internationale, OneHealth, experts op het gebied van AMR - inclusief softwareontwikkelaars, bioinformatici, en deskundigen op het gebeid van microbiële genomica, DNA-sequentietechnologieën en microbiële DNA-databanken.

(Verwachte) resultaten

Het project slaagde erin onderzoekers, bio-informatici en bedrijven samen te brengen om relevante kwesties te bespreken, waaronder twee online Seq4AMR algemene netwerkbijeenkomsten met in totaal 19 presentaties.