Mobiele menu

A long-read single molecule sequencing (LRSMS) system to further medical an biological research

De technieken om DNA volgordes af te lezen nemen een enorme vlucht. Het aangevraagde LRSMS-systeem maakt het mogelijk om te filmen hoe een DNA draad wordt gekopieerd en tegelijkertijd de DNA volgorde af te lezen. Toepassing in onderzoek en diagnostiek geeft ongekende nieuwe mogelijkheden.

Verslagen


Eindverslag

De technologie om DNA af te lezen (sequencing) ontwikkelt zich in een razend tempo. Een van de laatste ontwikkelingen is de zogenaamde "Single Molecule Sequencing" (SMS) technologie van de firma Pacific Biosciences (Menlo Park, USA). In vergelijking met bestaande technologieƫn heeft SMS diverse unieke eigenschappen; het aflezen van losse DNA moleculen, veel langere leeslengtes (tot tienduizenden letters), het direct aantonen van chemisch veranderde DNA bouwstenen (bijv. methyleringen), korte afleestijden (uren). Deze eigenschappen geven de mogelijkheid studies uit te voeren die voorheen niet mogelijk danwel niet betaalbaar waren. M.b.v de Investeringssubsidie waren wij in staat een Pacific Biosystems systeem aan te schaffen. Na aflevering (eind 2011), installatie en training is het systeem sinds zomer 2012 in gebruik. Het systeem is door diverse, vooral Nederlandse onderzoekers gebruikt en de uitgevoerde experimenten hebben diverse publicaties in gerenommeerde wetenschappelijke tijdschriften opgeleverd.

Onderwerpen

Kenmerken

Projectnummer:
91111014
Looptijd: 100%
Looptijd: 100 %
2011
2016
Gerelateerde programma's:
Gerelateerde subsidieronde:
Projectleider en penvoerder:
Prof. dr. J.T. den Dunnen
Verantwoordelijke organisatie:
Leiden University Medical Center