Mobiele menu

Purification and characterization of GATA-1 related transcription factor complexes and target genes by in vivo biotinylation tagging

Rode bloedcellen ontwikkelen zich uit voorlopercellen. Specifieke sets van genen worden aan- en uitgeschakeld zodat de cellen de vereiste ontwikkeling en differentiatie doormaken. Dat aan- en uitschakelen geschiedt onder invloed van specifieke factoren (transcriptiefactoren) in de cel. Een sleutelrol speelt de transcriptiefactor GATA-1. Deze is betrokken bij de vorming van verschillende eiwitcomplexen die zich aan het erfelijk materiaal in de cel hechten en zo de differentiatie sturen. Met een specifieke, door de onderzoekers ontwikkelde, techniek zijn diverse eiwitcomplexen en hun bindingsplaatsen op het genoom gekarakteriseerd in zebravissen en muizen. Nieuwe wegen van regulatie in bloedcellen zijn ontdekt, evenals een snelle techniek om grote hoeveelheden eiwitcomplexen te onderzoeken. Dat is wezenlijk voor het begrijpen van de cellulaire ontwikkeling in zoogdieren en daarmee samenhangende ziekten.

Producten

Titel: Isolation and characterization of hematopoietic transcription factor complexes by in vivo biotinylation tagging and mass spectrometry
Magazine: Annals of the New York Acadamy of Sciences
Titel: TFT Mapper: A BLAST search tool for identification of Transcription Factors Target Genes
Magazine: BMC Bioinformatics
Titel: Novel binding partners of Ldb1 are required for haematopoietic development.
Auteur: Rodriguez P, Braun H, Kolodziej KE, de Boer E, Campbell J, Bonte E, Grosveld F, Philipsen S, Strouboulis J.
Titel: ETO2 coordinates cellular proliferation and differentiation during erythropoiesis
Magazine: EMBO Journal
Titel: Multiple interactions between regulatory regions are required to stabilize an active chromatin hub.
Auteur: de Boer E, Rodriguez P, Bonte E, Krijgsveld J, Katsantoni E, Heck A, Grosveld F, Strouboulis J.
Titel: Characterization of megakaryocyte GATA1-interacting proteins: the corepressor ETO2 and GATA1 interact to regulate terminal megakaryocyte maturation.
Auteur: Sánchez C, Sánchez I, Demmers JA, Rodriguez P, Strouboulis J, Vidal M.
Titel: The genome-wide dynamics of the binding of Ldb1 complexes during erythroid differentiation.
Auteur: Soler E, Andrieu-Soler C, de Boer E, Bryne JC, Thongjuea S, Stadhouders R, Palstra RJ, Stevens M, Kockx C, van Ijcken W, Hou J, Steinhoff C, Rijkers E, Lenhard B, Grosveld F.
Magazine: Genes and Development
Titel: GATA-1 forms distinct activating and repressive complexes in erythroid cells.
Auteur: Patrinos GP, de Krom M, de Boer E, Langeveld A, Imam AM, Strouboulis J, de Laat W, Grosveld FG.
Titel: Isolation and characterization of hematopoietic transcription factor complexes by in vivo biotinylation tagging and mass spectrometry.
Auteur: Schuh AH, Tipping AJ, Clark AJ, Hamlett I, Guyot B, Iborra FJ, Rodriguez P, Strouboulis J, Enver T, Vyas P, Porcher C.
Titel: ETO-2 associates with SCL in erythroid cells and megakaryocytes and provides repressor functions in erythropoiesis.
Magazine: Molecular and Cellular Biology
Titel: Proteomics analysis of Ring1B/Rnf2 interactors identifies a novel complex with the Fbxl10/Jhdm1B histone demethylase and the Bcl6 interacting corepressor.
Auteur: Meier N, Krpic S, Rodriguez P, Strouboulis J, Monti M, Krijgsveld J, Gering M, Patient R, Hostert A, Grosveld F.
Titel: ETO2 coordinates cellular proliferation and differentiation during erythropoiesis.
Auteur: Grosveld F, Rodriguez P, Meier N, Krpic S, Pourfarzad F, Papadopoulos P, Kolodziej K, Patrinos GP, Hostert A, Strouboulis J.
Titel: Novel binding partners of Ldb1 are required for hematopoietic development
Magazine: Development
Titel: Isolation of transcription factor complexes by in vivo biotinylation tagging and direct binding to streptavidin beads.
Auteur: Horsman S, Moorhouse MJ, de Jager VC, van der Spek P, Grosveld F, Strouboulis J, Katsantoni EZ.
Titel: GATA-1 forms distinct activating and repressive complexes in erythroid cells
Magazine: EMBO Journal
Titel: A generic tool for biotinylation of tagged proteins in transgenic mice
Magazine: Transgenic Research
Titel: TF Target Mapper: a BLAST search tool for the identification of Transcription Factor target genes.
Auteur: Goardon N, Lambert JA, Rodriguez P, Nissaire P, Herblot S, Thibault P, Dumenil D, Strouboulis J, Romeo PH, Hoang T.
Titel: Isolation of transcription factor complexes by in vivo biotinylation tagging and direct binding to streptavidin beads
Magazine: Methods Mol Biol
Titel: A generic tool for biotinylation of tagged proteins in transgenic mice.
Auteur: Rodriguez P, Bonte E, Krijgsveld J, Kolodziej KE, Guyot B, Heck AJ, Vyas P, de Boer E, Grosveld F, Strouboulis J.
Titel: ETO-2 associates with SCL in erythroid cells and megakaryocytes and provides repressor functions in erythropoiesis.
Auteur: Driegen S, Ferreira R, van Zon A, Strouboulis J, Jaegle M, Grosveld F, Philipsen S, Meijer D.

Verslagen


Eindverslag

Het doel van dit project is de ontwikkeling en differentiatie van erythroide cellen te leren begrijpen, op basis van de functie van sleutel-transcriptiefactoren in hematopoiese, nl. GATA-1 en interactieve partners.
Er zijn 3 'key objectives':
1. De isolatie en karakterisering van eiwitcomplexen die gevormd worden door GATA-1 en interactieve partners in erythroide cellen.
2. De identificatie van erythroide gen doelen voor GATA-1 en interactieve factoren.
3. De functionele karakterisering van nieuw geidentificeerde eiwitpartners door genetische en biochemische middelen.

Het einddoel van dit project is het proberen te doorgronden van de ontwikkeling en differentiatie van erythroide cellen m.b.v. de 'sleutel' transcriptiefactor-functies in hematopoiese, nl. GATA-1 en zijn interactieve partners.

Onderwerpen

Kenmerken

Projectnummer:
91204041
Looptijd: 100%
Looptijd: 100 %
2004
2008
Onderdeel van programma:
Gerelateerde subsidieronde:
Projectleider en penvoerder:
Dr. I. Strouboulis PhD
Verantwoordelijke organisatie:
Erasmus MC