Purification and characterization of GATA-1 related transcription factor complexes and target genes by in vivo biotinylation tagging
Rode bloedcellen ontwikkelen zich uit voorlopercellen. Specifieke sets van genen worden aan- en uitgeschakeld zodat de cellen de vereiste ontwikkeling en differentiatie doormaken. Dat aan- en uitschakelen geschiedt onder invloed van specifieke factoren (transcriptiefactoren) in de cel. Een sleutelrol speelt de transcriptiefactor GATA-1. Deze is betrokken bij de vorming van verschillende eiwitcomplexen die zich aan het erfelijk materiaal in de cel hechten en zo de differentiatie sturen. Met een specifieke, door de onderzoekers ontwikkelde, techniek zijn diverse eiwitcomplexen en hun bindingsplaatsen op het genoom gekarakteriseerd in zebravissen en muizen. Nieuwe wegen van regulatie in bloedcellen zijn ontdekt, evenals een snelle techniek om grote hoeveelheden eiwitcomplexen te onderzoeken. Dat is wezenlijk voor het begrijpen van de cellulaire ontwikkeling in zoogdieren en daarmee samenhangende ziekten.
Magazine: Annals of the New York Acadamy of Sciences
Magazine: BMC Bioinformatics
Auteur: Rodriguez P, Braun H, Kolodziej KE, de Boer E, Campbell J, Bonte E, Grosveld F, Philipsen S, Strouboulis J.
Magazine: EMBO Journal
Auteur: de Boer E, Rodriguez P, Bonte E, Krijgsveld J, Katsantoni E, Heck A, Grosveld F, Strouboulis J.
Auteur: Sánchez C, Sánchez I, Demmers JA, Rodriguez P, Strouboulis J, Vidal M.
Auteur: Soler E, Andrieu-Soler C, de Boer E, Bryne JC, Thongjuea S, Stadhouders R, Palstra RJ, Stevens M, Kockx C, van Ijcken W, Hou J, Steinhoff C, Rijkers E, Lenhard B, Grosveld F.
Magazine: Genes and Development
Auteur: Patrinos GP, de Krom M, de Boer E, Langeveld A, Imam AM, Strouboulis J, de Laat W, Grosveld FG.
Auteur: Schuh AH, Tipping AJ, Clark AJ, Hamlett I, Guyot B, Iborra FJ, Rodriguez P, Strouboulis J, Enver T, Vyas P, Porcher C.
Magazine: Molecular and Cellular Biology
Auteur: Meier N, Krpic S, Rodriguez P, Strouboulis J, Monti M, Krijgsveld J, Gering M, Patient R, Hostert A, Grosveld F.
Auteur: Grosveld F, Rodriguez P, Meier N, Krpic S, Pourfarzad F, Papadopoulos P, Kolodziej K, Patrinos GP, Hostert A, Strouboulis J.
Magazine: Development
Auteur: Horsman S, Moorhouse MJ, de Jager VC, van der Spek P, Grosveld F, Strouboulis J, Katsantoni EZ.
Magazine: EMBO Journal
Magazine: Transgenic Research
Auteur: Goardon N, Lambert JA, Rodriguez P, Nissaire P, Herblot S, Thibault P, Dumenil D, Strouboulis J, Romeo PH, Hoang T.
Magazine: Methods Mol Biol
Auteur: Rodriguez P, Bonte E, Krijgsveld J, Kolodziej KE, Guyot B, Heck AJ, Vyas P, de Boer E, Grosveld F, Strouboulis J.
Auteur: Driegen S, Ferreira R, van Zon A, Strouboulis J, Jaegle M, Grosveld F, Philipsen S, Meijer D.
Het doel van dit project is de ontwikkeling en differentiatie van erythroide cellen te leren begrijpen, op basis van de functie van sleutel-transcriptiefactoren in hematopoiese, nl. GATA-1 en interactieve partners.
Er zijn 3 'key objectives':
1. De isolatie en karakterisering van eiwitcomplexen die gevormd worden door GATA-1 en interactieve partners in erythroide cellen.
2. De identificatie van erythroide gen doelen voor GATA-1 en interactieve factoren.
3. De functionele karakterisering van nieuw geidentificeerde eiwitpartners door genetische en biochemische middelen.
Het einddoel van dit project is het proberen te doorgronden van de ontwikkeling en differentiatie van erythroide cellen m.b.v. de 'sleutel' transcriptiefactor-functies in hematopoiese, nl. GATA-1 en zijn interactieve partners.