Mobiele menu

VRE-crossword, horizontal or vertical? Transmission of vancomycin-resistant Enterococcus faecium in Dutch hospitals.

Antibioticaresistentie aanpakken door toegankelijker maken van bestaande genetische data van resistente bacteriën

De darmbacterie Enterococcus faecium is van nature aanwezig in de darmen van mens en dier en heeft zich ontwikkeld tot een antibiotica-resistente bacterie verantwoordelijk voor ziekenhuisinfecties. Sinds 2012 zijn er in Nederlandse ziekenhuizen 87 uitbraken gerapporteerd geweest met deze bacterie.
Recent hebben onderzoekers in het UMC Utrecht de complete genetische samenstelling van deze bacteriën, die zijn verzameld tijdens ziekenhuisuitbraken, in kaart gebracht. In dit project worden deze genetische gegevens inzichtelijker en bruikbaarder gemaakt voor verder onderzoek naar de verspreiding van deze resistente bacterie in Nederlandse ziekenhuizen. Daarvoor zal o.a. een online app worden ontwikkeld om ziekenhuis uitbraken sneller en beter in kaart te brengen. Dit zal niet alleen het inzicht in de verspreiding van resistentie vergroten maar ook bijdragen aan de bestrijding.

Producten

Titel: ClonalTracker: A new pipeline to survey vancomycin-resistant Enterococcus faecium outbreaks
Auteur: Victoria Pascal Andreu, Janetta Top, Rob Willems, Anita Schurch
Titel: Challenges in investigating transmission of vancomycin resistant Enterococcus faecium: tracking clonal and horizontal relatedness
Auteur: A. Schurch
Link: https://www.scientificspringmeeting.nl/programme/
Titel: ClonalTracker: A new pipeline to survey vancomycin-resistant Enterococcus faecium outbreaks
Auteur: Victoria Pascal Andreu, Janetta Top, Rob Willems and Anita Schurch
Link: https://ice6.org/
Titel: The role of E.faecium plasmids in the dissemination of antibiotic resistance genes
Auteur: Anita Schurch
Link: https://uit.no/research/amrbridge
Titel: ClonalTracker: A new pipeline to survey vancomycin-resistant Enterococcus faecium
Auteur: Victoria Pascal Andreu, Janetta Top, Rob Willems, Anita Schurch
Link: https://www.escmid.org/dates-events/escmid-conferences/immem-xiii
Titel: Plasmid genomics of Enterococcus faecium and Enterococcus faecalis
Auteur: Anita Schurch
Titel: Mode and dynamics of vanA-type vancomycin resistance dissemination in Dutch hospitals
Auteur: S. Arredondo-Alonso, J. Top, J. Corander, R. Willems, A. Schürch
Magazine: Genome Medicine
Begin- en eindpagina:
Titel: PlasmidEC and gplas2: an optimized short-read approach to predict and reconstruct antibiotic resistance plasmids in Escherichia coli
Auteur: Julian A. Paganini, Jesse J. Kerkvliet?, Lisa Vader?, Nienke L. Plantinga?, Rodrigo Meneses?, Jukka Corander?, Rob J. L. Willems?, Sergio Arredondo-Alonso? and Anita C. Schürch
Magazine: Microbial Genomics
Link: https://doi.org/10.1099/mgen.0.001193
Titel: Mge-cluster: a reference-free approach for typing bacterial plasmids
Auteur: Sergio Arredondo-Alonso,corresponding author Rebecca A Gladstone, Anna K Pöntinen, João A Gama, Anita C Schürch, Val F Lanza, Pål Jarle Johnsen, Ørjan Samuelsen, Gerry Tonkin-Hill, and Jukka Corander
Magazine: NAR Genom Bioinform

Onderwerpen

Kenmerken

Projectnummer:
541003005
Looptijd: 100%
Looptijd: 100 %
2020
2023
Onderdeel van programma:
Gerelateerde subsidieronde:
Projectleider en penvoerder:
dr. A.C. Schürch
Verantwoordelijke organisatie:
Universitair Medisch Centrum Utrecht