Achtergrond afbeelding Achtergrond afbeelding darkmode

VRE-crossword, horizontal or vertical? Transmission of vancomycin-resistant Enterococcus faecium in Dutch hospitals.

De darmbacterie Enterococcus faecium is van nature aanwezig in de darmen van mens en dier. De bacterie heeft zich ontwikkeld tot een antibioticaresistente bacterie verantwoordelijk voor ziekenhuisinfecties. Tussen 2012 en 2020 zijn er in Nederlandse ziekenhuizen 87 uitbraken gerapporteerd met deze bacterie.

Doel

Het doel van dit project was om ziekenhuisinfecties met resistente E. faecium beter te begrijpen en sneller te kunnen bestrijden. Hiervoor zijn bestaande genetische gegevens van de bacterie beter toegankelijk gemaakt voor onderzoekers en zorgprofessionals.

Werkwijze

Onderzoekers van het UMC Utrecht hebben de genetische eigenschappen van de bacterie in kaart gebracht. Deze gegevens zijn verzameld tijdens ziekenhuisuitbraken. De informatie is verwerkt volgens de FAIR-principes, zodat deze makkelijk vindbaar, bruikbaar en deelbaar is.

Resultaten

Onderzoekers hebben een online tool ontwikkeld om ziekenhuisuitbraken sneller en preciezer in kaart te brengen. Dit verbetert het begrip van de verspreiding van antibioticaresistentie en draagt bij aan effectievere bestrijdingsmaatregelen.

Producten

Titel: ClonalTracker: A new pipeline to survey vancomycin-resistant Enterococcus faecium outbreaks
Auteur: Victoria Pascal Andreu, Janetta Top, Rob Willems, Anita Schurch
Titel: Challenges in investigating transmission of vancomycin resistant Enterococcus faecium: tracking clonal and horizontal relatedness
Auteur: A. Schurch
Link: https://www.scientificspringmeeting.nl/programme/
Titel: ClonalTracker: A new pipeline to survey vancomycin-resistant Enterococcus faecium outbreaks
Auteur: Victoria Pascal Andreu, Janetta Top, Rob Willems and Anita Schurch
Link: https://ice6.org/
Titel: The role of E.faecium plasmids in the dissemination of antibiotic resistance genes
Auteur: Anita Schurch
Link: https://uit.no/research/amrbridge
Titel: ClonalTracker: A new pipeline to survey vancomycin-resistant Enterococcus faecium
Auteur: Victoria Pascal Andreu, Janetta Top, Rob Willems, Anita Schurch
Link: https://www.escmid.org/dates-events/escmid-conferences/immem-xiii
Titel: Plasmid genomics of Enterococcus faecium and Enterococcus faecalis
Auteur: Anita Schurch
Titel: Mode and dynamics of vanA-type vancomycin resistance dissemination in Dutch hospitals
Auteur: S. Arredondo-Alonso, J. Top, J. Corander, R. Willems, A. Schürch
Magazine: Genome Medicine
Begin- en eindpagina: 13-
Titel: PlasmidEC and gplas2: an optimized short-read approach to predict and reconstruct antibiotic resistance plasmids in Escherichia coli
Auteur: Julian A. Paganini, Jesse J. Kerkvliet?, Lisa Vader?, Nienke L. Plantinga?, Rodrigo Meneses?, Jukka Corander?, Rob J. L. Willems?, Sergio Arredondo-Alonso? and Anita C. Schürch
Magazine: Microbial Genomics
Link: https://doi.org/10.1099/mgen.0.001193
Titel: Mge-cluster: a reference-free approach for typing bacterial plasmids
Auteur: Sergio Arredondo-Alonso,corresponding author Rebecca A Gladstone, Anna K Pöntinen, João A Gama, Anita C Schürch, Val F Lanza, Pål Jarle Johnsen, Ørjan Samuelsen, Gerry Tonkin-Hill, and Jukka Corander
Magazine: NAR Genom Bioinform

Kenmerken

  • Projectnummer:
    541003005
  • Looptijd: 100%
    Looptijd: 100 %
    2020
    2023
  • Gerelateerde programma's:
  • Gerelateerde subsidieronde:
  • Projectleider en penvoerder:
    dr. A.C. Schürch
  • Verantwoordelijke organisatie:
    Universitair Medisch Centrum Utrecht