Monitoring the evolution, spread and transmission of SARS-CoV-2 through whole genome sequencing to enable fast genotype to phenotype prediction
Tijdens dit project heeft dit project de evolutie en de verspreiding van SARS-CoV-2 (het virus dat COVID-19 veroorzaak) in Nederland in kaart gebracht. Ze hebben deze informatie gebruikt in verschillende fases van de pandemie: in de eerste fase hebben ze dit gebruikt om de omvang van de pandemie in Nederland in te schatten, daarna hebben ze de evolutie van het virus in nertsen in kaart gebracht en getracht de verspreiding van het virus tussen nertsenboerderijen in te dammen. In een latere fase van de pandemie keken ze naar herinfecties en hoe het virus veranderde in patiënten die gedurende lange tijd met SARS-CoV-2 waren geïnfecteerd. Gezamenlijk hebben deze bevindingen bijgedragen aan het vergroten van de kennis met betrekking tot het verloop van de pandemie en kunnen deze resultaten gebruikt worden om beter voorbereid te zijn op toekomstige varianten. Ook kunnen de resultaten zorgen dat er een snellere vertaalslag tussen de bevindingen in het lab en de mogelijk impact van deze bevindingen gemaakt kan worden.